Il parco copre un'area di 1460 ettari nell'alta pianura lombarda, a nord-ovest rispetto alla città di Milano.

I comuni interessati sono quelli di Origgio, Uboldo e Gerenzano in provincia di Varese e Cerro Maggiore nella città metropolitana di Milano. Il Parco si estende nelle aree agricolo e boschive situate lungo il corso inferiore del torrente Bozzente, a pochi chilometri di distanza della sua confluenza nel fiume Olona.

Confina inoltre con altri tre parchi sovracomunali: a nord con il parco del bosco del Rugareto e con il parco del fontanile di San Giacomo e a sud con il parco dei Mulini.

Il territorio del parco fa parte delle aree prioritarie per la conservazione della biodiversità nella pianura lombarda. L'area è una delle ultime zone verdi e non urbanizzate dell'Altomilanese: è infatti circondata dalle conurbazioni del bustese, del legnanese e del saronnese, oltre alla presenza delle autostrade A8 Milano-Varese e A9 Lainate-Como-Chiasso.

Il territorio è costituito per più delle metà da aree agricole coltivate mentre restante parte è costituita da boschi: quello più compatto ed esteso è situato ad Origgio (bosco del Conte), mentre nel territorio di Uboldo e Cerro Maggiore le aree verdi risultano esser meno estese e più irregolari.

Il parco dei Mughetti è uno spazio verde comodamente e facilmente accessibile a tutti.